학술웨비나 - 연구성과
RNA chaperone (FinO/ProQ)의 선택적 sRNA인식에 대한 구조적 이해 [Nat. Commun.]

sRNA를 통한 전사 후 조절 (post-transcriptional regulation) 기작은 박테리아 내에서 중요한 역할을 합니다. sRNA는 전사 후 조절인자로서의 역할 수행을 위해 고차원적인 구조가 재정렬되어야 하며, 이때 RNA chaperone이라는 단백질이 주로 이 역할을 수행합니다. FinO domain을 가진 RNA chaperone은 γ-proteobacteria에 폭넓게 존재하며, 전사종결인자 (transcriptional terminator) 구조의 sRNA에 선택적으로 결합한다고 알려져 있으나, 구체적인 메커니즘은 보고된 바가 없습니다. 본 연구에서는 FinO family 중 하나인 RocC 단백질과 타겟 sRNA의 결합구조를 X-ray 결정학으로 규명해 내었습니다. RocC는 전사종결인자 구조의 stem 하단과 3’ tail을 통하여 결합하였으며, 흥미롭게도, stem 하단부 중에서도 오직 3’ 쪽 만을 통하여 결합하였습니다. 특히, 단백질의 RNA인식에 있어, 3’ tail 끝의 수산기의 중요성을 구조에서 관찰하고, 실험적으로 증명해 내었습니다. 추가적으로, 포괄적인 site-directed mutagenesis를 통하여 RNA와의 결합과 기능적으로 중요한 단백질 잔기들을 밝혀내었습니다. 본 연구는 어떻게 박테리아 단백질이 전사종결인자를 인식하는지에 대한 구조적 이해를 제공하였습니다.

X-ray 결정학, RNA binding protein, sRNA

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Structural basis for recognition of transcriptional terminator structures by ProQ/FinO domain RNA chaperones
Nat. Commun., 2022 Nov 18;13(1):7076 | doi: 10.1038/s41467-022-34875-5

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